生化学的農薬は最近非常に注目されている農薬であり、次の 2 つの要件を満たす必要があります。1 つは、制御対象に対して直接的な毒性はなく、成長の調節、交尾や誘引の妨害などの特殊な効果のみを有することです。もう一方は天然化合物ですが、人工的に合成されたものであれば、その構造は天然化合物と同じでなければなりません（異性体比率の違いは許容されます）。これには主に次のカテゴリが含まれます: 化学情報化学物質、天然植物成長調節剤、天然昆虫成長調節剤、天然植物抵抗性物質など。

微生物農薬とは、細菌、真菌、ウイルス、原生動物、遺伝子組み換え微生物などの生物を有効成分として使用する農薬を指します。バチルス属、ストレプトミセス属、シュードモナス属など。

植物性農薬とは、有効成分が植物から直接得られる農薬を指します。マトリン、アザジラクチン、ロテノン、オストホールなど。

農業用抗生物質とは、微生物の生命活動の過程で生成される天然有機物質を指し、低濃度で植物病原体に対して特異的な薬理効果（主に病原菌を阻害または死滅させる効果を指します）を示します。アベルメクチン、カスガマイシン、スピノサド、イベルメクチン、ジンガンマイシンなど。

ただし、農業用抗生物質は微生物の発酵によって生産されることを指摘しておく必要があります。同じ生物農薬ではありますが、登録データ要件に関しては、製品の特性上提供できない一部の試験項目（軽減申請可能）を除き、その他は基本的に化学農薬と同等です。現在、抗生物質農薬を生物農薬として扱っている国は世界中でほとんどありませんが、供給源、研究、応用状況の観点から見ると、我が国の歴史においても現在においても、抗生物質農薬は依然として生物農薬の非常に重要なカテゴリーです。